メルペイは、2020年3月4日（水）より、靴修理などの「ミスターミニット」でコード決済を導入した。
ミスターミニットでは、メルカリに掲載されている商品の画面を店員に見せて、修理やクリーニングが可能かどうかを確認してから商品を購入するケースが増えており、親和性が高い事からメルペイを導入した。
メルペイはメルカリの売上金を利用する事ができるスマホ決済サービスとなり、残高が足りない場合は、対象の金融機関口座を登録する事でチャージすることができる。一度設定すると、2回目以降はアプリ操作だけでチャージが可能だ。
2020年3月4日（水）～3月13日（金）までの間、ミスターミニット各店でメルペイのコード決済払いすると、支払金額の10％のポイントを還元するキャンペーンが開始した。1回の支払につき500ポイントが上限となり、期間中は1,000ポイントまでとなる。iD決済は対象外。