PayPayは、2019年10月1日（火）より、PayPay残高やYahoo! JAPANカードでの支払いで還元するPayPayボーナスを1.5％に変更すると発表した。
現在、PayPay残高またはYahoo! JAPANカードでの支払い時には3.0％のPayPayボーナスを獲得できるが、1.5％と半減する。また、Yahoo! JAPANカード以外のクレジットカードでの支払い時には0.5％還元を受けられるが、10月以降は還元なしに切り替わる。
なお、2019年10月1日（火）より、政府によるキャッシュレス・消費者還元事業が開始し、中小企業での支払いの場合は5％還元、フランチャイズ店の場合は2％還元となり、これらを合計すると、最大6.5％還元を受けられる。
さらに、2019年10月1日（火）～11月30日（土）までの間、中小企業でPayPayを利用すると、PayPay残高またはYahoo! JAPANカードでの支払いに限り3.5％のPayPayボーナスを獲得できるキャンペーンを実施する。期間中の合計還元率は最大10％となる。
| 支払方法 | キャッシュレス・消費者還元事業 | キャンペーン | PayPay利用特典 | 合計還元率 | |
| 中小の小売店 | PayPay残高またはYahoo! JAPANカード | 5％ | 3.5％ | 1.5％ | 10％ |
| Yahoo! JAPANカード以外のクレジットカード | 5％ | ─ | ─ | 5％ | |
| 中小のフランチャイズ店 | PayPay残高またはYahoo! JAPANカード | 2％ | ─ | 1.5％ | 3.5％ |
| Yahoo! JAPANカード以外のクレジットカード | 2％ | ─ | ─ | 2％ |