メルペイは、2019年6月13日（木）より、ジャパンネット銀行と連携した。
メルペイは、フリマアプリのメルカリの売上金をiD加盟店やQRコード・バーコード決済加盟店で利用する事ができるスマホ決済サービスとなり、不足分を銀行口座からチャージすることで支払うことが可能だ。
事前に銀行口座を登録しておくと、アプリの操作だけでチャージすることができ、チャージした金額はメルカリの売上金と合算して利用する事ができる。
新たにジャパンネット銀行と連携し、メルペイにジャパンネット銀行を登録する事で、2回目以降はアプリ操作だけでチャージが可能となった。