WAONでは、2020年7月から登録開始となるマイナポイントでWAONを選択すると、9月以降最大2,000ポイント獲得できるキャンペーンを実施する。
マイナポイント事業で、電子マネーWAONを登録し、WAONにチャージすると、最大25％（5,000円分が上限）還元を受けられる。WAONを登録した場合は、別途チャージ額の10％を獲得することが可能だ。2万円をチャージしたときが最大となり、5,000円分＋2,000円分を獲得できる。
チャージは、現金チャージ、クレジットチャージ、口座チャージ、オートチャージが対象となり、WAONポイントでの電子マネー交換は対象外だ。
マイナポイントの受取は、WAONステーションやイオン銀行ATM、WAOMチャージャーmini、Famiポート、モバイルWAONで受け取ることが可能だ。受取期間に有効期限はない。