メルペイは、2019年7月1日（月）より、島村楽器の一部店舗でコード決済を導入した。
島村楽器では、クレジットカードや電子マネーに続く手軽な決済手段としてスマホ決済の導入を進めており、2019年2月8日（金）にはPayPayを導入した。
新たにメルペイのコード決済に対応し、メルカリのアプリからメルペイを選択し、表示されるバーコードやQRコードを店舗で読み取る事で支払う事が可能だ。
メルペイは、メルカリの売上金を利用して支払う事ができ、不足分は銀行口座からチャージする事で支払う事ができる。コード決済に対応していない店舗でも、iD加盟店であれば利用する事が可能だ。
メルペイでの決済時にはポイントが貯まらないが、クーポンが豊富となっている。