サンマルクカフェでは、2019年4月1日（月）より、サンマルクカフェ公式アプリの提供を開始した。
サンマルクカフェ公式アプリは、ポイントが貯まり、クーポンを利用できるアプリとなる。アプリを起動し、ポイントボタンをタップするとバーコードが表示されるため、店頭で読み込んでもらうことで商品点数につき1ポイント貯まる。ある程度のポイントが貯まるとクーポンと交換する事ができ、来店時にクーポンを利用することが可能となる。
また、dポイントとの連携もしており、画面右下のdポイントマークをタップすると会員証画面が表示される。バーコードを読み込んでもらうことで100円（税込）につき1 dポイントを貯めることが可能だ。