Amazon.co.jpでは、2022年5月10日（火）より、スマホ決済サービスのPayPayを導入した。
Amazon.co.jpでの購入時にPayPayのアカウントを連携すると、支払い方法の選択画面でPayPayを選ぶことができるようになる。
Amazon.co.jpでの利用の場合はPayPayマネーおよびPayPayポイントのみ利用でき、それ以外は利用できない。ソフトバンクまとめて支払いや、PayPayあと払いでは、Amazon.co.jpで利用できず、登録済みの銀行口座やコンビニATMなどでのチャージしたPayPayマネーで利用可能だ。