楽天ブックスでは、2020年8月27日（木）より、代金引換サービスで商品を購入し、配送サービス「Rakuten EXPRESS」による配送対象の場合、受取時の決済手段としてスマホ決済サービス「楽天ペイ（アプリ決済）」の利用が可能となった。
Rakuten EXPRESSは、楽天が運営する配送サービスとなり、Rakuten24や楽天ブックス、Rakuten Fashiion、楽天ビックなどの一部商品を36都道府県で配送サービスを展開している。
楽天ブックスで代金引換サービスを利用する際は305円（税込）の手数料が必要となるが、商品を受け取り時の決済手段として楽天ペイ（アプリ決済）を利用可能となった。
楽天ペイ（アプリ決済）は、楽天会員向けのスマホ決済サービスとなり、クレジットカードや楽天ポイント、楽天キャッシュを利用して支払う事ができる。Rakuten EXPRESS利用時には提示されたQRコードをアプリで読取り、金額を入力することで支払いが完了する。