セブン-イレブン・ジャパンは、2020年10月以降、セブン-イレブンアプリ内の決済機能としてPayPayを搭載する。
セブン-イレブンアプリにPayPayが搭載されることで、画面上にPayPayの支払いバーコードが表示され、全国のセブン-イレブン店舗で決済が可能となる。
また、セブン-イレブンアプリの会員コード提示で受けとれるバッジやセブンマイルとPayPay残高による支払いで受けとれるPayPayボーナスが同時に受けとることが可能となる。セブンマイルは200円（税抜）につき1マイル、PayPayボーナスは支払額の0.5～1.5％分獲得できる。
なお、セブン-イレブンアプリ内のPayPay機能は全国のセブン-イレブン店舗のみとなり、その他のPayPay加盟店では利用できない。PayPayの支払方法の登録はPayPayアプリでのみ操作可能となり、セブン-イレブンアプリでPayPayアプリを登録する事で銀行口座やYahoo! JAPANカードなどからPayPay残高にチャージできるようになる。