近商ストアでは、2020年2月17日（月）より、スマホ決済サービスのメルペイを導入した。
メルペイはメルカリの売上金を利用できるスマホ決済サービスとなり、iD加盟店やコード決済加盟店で利用する事が可能だ。残高不足の場合は提携している銀行口座を登録する事で、メルペイからチャージすることができる。
レジでは、メルペイのアプリに表示されているバーコードをスキャンしてもらうことで残高の範囲内で支払う事が可能だ。なお、近鉄グループのポイントカードであるKIPSカードを提示すれば、メルペイでの決済時でも200円（税抜）につき1 KIPSポイントを獲得することができる。
近商ストアでは、既にPayPay、楽天ペイ（アプリ決済）、LINE Payを導入しており、新たにメルペイも導入した。