クラブメッドは、2019年3月より、JALマイレージバンクと提携を開始した。
クラブメッド対象施設の利用で1回の利用につき500マイルが貯まる。
対象施設は、クラブメッド・石垣島、クラブメッド・北海道 トマム、クラブメッド・北海道 サホロの3箇所となり、「マイレージ申請フォーム」から申請しなければマイルの獲得は出来ない。なお、2019年4月以降の滞在分についてはチェックイン後の申請は対象外となるため、チェックイン前の申請が必要となる。
クラブメッドでは、1回の利用につき500マイル貯まるサービスをANAでも実施しており、JALとANAを選択できるようになった。