ヤフーとソフトバンクの合弁会社であるPayPayは、スマホ決済サービス「PayPay」と「Yahoo! JAPAN」アプリの連携を2018年11月12日（月）より開始した。
Yahoo! JAPANアプリから利用するには、初回利用時にYahoo! JAPAN IDとPayPayの連携登録が必要だ。
PayPayにクレジットカードを登録し、実店舗でバーコードやQRコードを使った決済すると、登録したクレジットカードのポイントを貯めることができる。
PayPayでの支払は、Yahoo! JAPANアプリを起動し、PayPayをタップ。事業者側が提示したQRコードをアプリで読み取るか、ユーザーが提示したバーコードまたはQRコードを事業者側で読み取るかで支払が完了する。