国内線ドットコムは、2016年1月26日（火） 23:00で航空券発売サービスを終了すると発表した。
2016年3月26日（土）までの予約はPCサイト、モバイルサイトで変更は可能だが、2016年3月27日（日）以降の予約変更は2016年3月31日（木）までは国内線ドットコムカスタマーサポートセンター、2016年4月1日（金）以降は各航空会社の国内線予約センターでの対応となる。
サービス終了に伴い、加盟店のPontaサービスも終了する。なお、国内線ドットコムでためたPontaポイントは2016年1月27日（水）以降もPonta加盟店で利用することが可能だ。
