丸善ジュンク堂書店が運営する「丸善ジュンク堂書店ネットストア」は2025年3月17日（月）から、書籍や雑誌、オリジナル商品を含む一部の文房具・雑貨商品を取り扱うネット通販サービスを開始した。
これまでに提供していた書籍や一部の雑貨商品の店舗受け取りサービス（取り置き・取り寄せ）に加え、宅配便等にて自宅などに届けするネット通販サービスを開始。
ネット通販サービスはwebサイトだけでなく、2024年12月から運用を開始した「丸善ジュンク堂書店アプリ」からも利用可能だ。
ネット通販での購入でもhontoポイントも獲得できる。なお、hontoポイントの利用は今後対応する予定だ。