トップツアーが東武トラベルと合併し、2015年4月1日(水)より東武トップツアーズとなったことで、スカイ・トラベラー・カードのボーナスポイント対象旅行代理店からトップツアーが外れることとなった。
2015年5月31日(日)まではトップツアーでの支払いでスカイ・トラベラー・カードを利用するとポイント3倍、スカイ・トラベラー・プレミアム・カードでポイント5倍となるが、2015年6月1日(月)以降はポイント倍付けの対象外となる。
なお、スカイ・トラベラー・カードの利用でポイント倍付の対象となる旅行代理店は日本旅行とアップルワールドがあり、2015年6月1日(月)以降も利用可能となっている。