クラブメッドは、2018年6月1日（金）より、ANAと提携し、クラブメットでの滞在でANAのマイルが貯まるサービスを開始した。
クラブメッドの対象施設を利用すると1回につき500マイルが貯まる。対象施設はクラブメッド・石垣島、クラブメッド・北海道 トマム、クラブメッド・北海道 サホロの3施設となり、それ以外の施設ではマイル積算の対象外となる。
クラブメッドの公式サイトから予約後、チェックイン前日までに「マイレージ申請フォーム」から申請が必要だ。申請にはANAマイレージクラブお客様番号、クラブメッド予約番号、氏名、出発日と帰着日、対象施設の入力が必要となる。
なお、チェックイン後に申請してもマイルの付与はできないので注意が必要だ。